Стороженко І.С. Збройні сили України від останньої третини XVII ст. до кінця XVIII ст. // УІЖ. – 1998. – № 1. – С. 87–93.
Стороженко І.С. Трансформація полкового устрою держави Б. Хмельницького в паланковий лад Січі // Гуманітарний журнал. – 2001. – № 3–4 (11–12). – Літо – осінь. – С. 10–16.
Стороженко І.С. Актуальні проблеми дослідження та висвітлення воєнної історії в сучасній Україні // Грані. – 2002. – № 5 (25). – С. 48 – 51.
Стороженко І.С. Лицарська гіпотеза утворення Запорозької Січі // Київська старовина. – 2003. – № 5. – С. 29–46.
Стороженко І.С. Великий Кордон та українське козацтво: до питання генезису тюркських запозичень // Історіографічні та джерелознавчі проблеми історії України: Міжвуз. зб. наук. пр. – Дніпропетровськ: РВВ ДНУ, 2004. – С. 73–87.
Стороженко І.С. Організаційна структура українського козацтва, що передувала утворенню першої Запорозької Січі (друга половина XVI ст.) // Київська старовина. – 2004. – № 2. – С. 23-34.
Стороженко І.С. Перша Запорозька (Базавлуцька) Січ кінця XVІ – першої половини XVII ст. // Київська старовина. – 2005. – № 1. – С. 35–59.
Стороженко І.С. Перша Запорозька (Базавлуцька) Січ кінця XVІ – першої половини XVII ст. (продовження) // Київська старовина. – 2005. – № 2. – С. 34–59.
Стороженко І.С. Відродження Запорозької (Чортомлицької) Січі Богданом Хмельницьким у 1652 р. // Київська старовина. – 2005. – № 3. – С. 14–36.
Стороженко І.С. Еволюція етнічного складу українського козацтва кінця XV – середини XVII ст. // Київська старовина. – 2005. – № 4. – С. 3–18.
Стороженко І.С. Еволюція етнічного складу українського козацтва кінця XV – середини XVII ст. (продовження) // Київська старовина. – 2005. – № 5. – С. 47–66.
Стороженко І.С. Коли, де і за яких умов виникла перша Запорозька Січ // Наддніпрянська Україна: історичні процеси, події, постаті: Зб. наук. пр. – Дніпропетровськ: Вид-во ДНУ, 2005. – Вип. 3. – С. 98–113.
Стороженко І.С. До питання про існування Микитинської Січі // Вісник Дніпропетровського університету: Історія та археологія. – Дніпропетровськ: Вид-во ДНУ, 2005. – № 5. – С. 13–18.
Стороженко І.С. Великий Кордон і українське козацтво кінця XV – середини XVII ст. // Київська старовина. – 2006. – № 1. – С. 31–45.
Стороженко І.С. Дике Поле кінця XV – середини XVII ст. як складова частина Великого Кордону України // Київська старовина. – 2006. – № 2. – С. 12–20.
Стороженко І.С. Українське прикордоння кінця XV – середини XVII ст. // Київська старовина. – 2006. – № 4. – С. 30–37.
Стороженко І.С. Кримське ханство кінця XV – середини XVII ст. як складова частина Великого Кордону України // Київська старовина. – 2006. – № 5. – С. 3–12.
Стороженко І.С. Нова версія територіальної локації Жовтоводської битви 1648 року // Наддніпрянська Україна: історичні процеси, події, постаті: Зб. наук. пр. – Дніпропетровськ: Вид-во ДНУ, 2006. – Вип. 4. – С. 5–16.
Стороженко І.С. Коли ж виникли паланки на Запорозькій Січі? // Київська старовина. – 2007. – № 3. – С. 22–30.
Стороженко І.С. Історико-системний метод дослідження Запорозької Січі кінця XVI – середини XVII ст. // Київська старовина. – 2007. – № 4. – С. 3–24.
Стороженко І.С. Стан дослідження організаційної структури Запорозької Січі кінця XVI – середини XVII ст. // Вісник Дніпропетровського університету: Історія та археологія. – Дніпропетровськ: Вид-во ДНУ, 2007. – № 6. – С. 118–128.
Стороженко І.С. Чому Б. Хмельницький відродив Запорозьку Січ? // Бористен. – 2007. – № 8. – С. 17–19.
Стороженко І.С. Чи була на Микитиному Розі Запорозька Січ? // Бористен. – 2007. – № 9. – С. 14–16.