Анотація до роботи:

Данкевич Л.А. Фенотипові та генотипові властивості бактерій роду Pseudomonas збудників бурої бактеріальної плямистості люпину.

Дисертація на здобуття наукового ступеня кандидата біологічних наук за спеціальністю 03.00.07. мікробіологія. Інститут мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України, Київ, 2006.

Збудник бурої бактеріальної плямистості люпину виділений Л.Г. Бельтюковою та І.Б. Корольовою(1971) понад сорок років тому і сьогодні завдає значної шкоди бобовим культурам. На основі окремих фенотипових ознак цей збудник був визначений як новий вид „Pseudomonas lupini”. За вимогами сучасної таксономії цих ознак недостатньо для ідентифікації збудника на рівні виду. Тому дисертацію присвячено вивченню комплексу фенотипових та генотипових властивостей колекційних і свіжовиділених штамів „P. lupini”, необхідних для встановлення їхнього видового статусу.

Встановлена здатність як свіжовиділених так і колекційних штамів „P. lupini” уражати широке коло бобових культур. Виявлено, що більшість штамів „P. lupini” за патогенними, морфологічними, культуральними, біохімічними властивостями, а також жирнокислотним і антигенним складом клітин споріднені з типовим штамом P. syringae рv. syringae В1027, що ставить під сумнів існування окремого виду
„P. lupini”. Більшість штамів „P. lupini”, за виключенням штаму 8531, за вмістом ГЦ пар у геномній ДНК споріднені з штамом P. syringae рv. syringae В1027. Дані сиквенсу повнорозмірної ДНК-копії гену 16S рРНК підтвердили спорідненість більшості досліджених штамів з видом P. syringae. Натомість штам 8531 має 100% гомологію нуклеотидних послідовностей даного гену з P. sаvastanoi pv. glycinea. За даними аналізу фенотипових та генотипових властивостей більшість штамів віднесено до виду P. syringae і лише штам 8531 до виду P. sаvastanoi.

В роботі також показана залежність стійкості сорту люпину до збудника бурої бактеріальної плямистості люпину від вмісту у ньому алкалоїдів, що необхідно враховувати у селекції нових сортів.

1. Встановлено, що збудник бурої бактеріальної плямистості люпину „P. lupini” Beltjukova, Koroljova не є самостійним видом. За фенотиповими та генотиповими ознаками більшість штамів „P. lupini” віднесено до виду P. syringae.

2. За патогенними, морфологічними, культуральними, фізіологічними та біохімічними властивостями збудник бурої бактеріальної плямистості люпину є подібним до типового штаму P. syringae рv. syringae В1027.

3. Популяція збудника бурої бактеріальної плямистості у природі є серологічно гетерогенною: 88% досліджених штамів віднесено до ІІІ і лише 12% – до І серогрупи.

4. Вперше показано подібність жирнокислотних профілів клітинних ліпідів штамів „P. lupini” та типового штаму P. syringae рv. syringae В1027.

5. Вперше визначено гетерогенність вмісту ГЦ пар у геномній ДНК збудника бурої бактеріальної плямистості люпину. За цією ознакою більшість штамів подібні до виду P. syringae і тільки штам 8531 до виду P. sаvastanoi.

6. Вперше визначено нуклеотидні послідовності гену 16S рРНК 7 штамів
„P. lupinі”. Встановлено, що 6 штамів за цією ознакою на 98-99% споріднені з видом P. syringae, а штам 8531 має 100% гомологію з P. sаvastanoi pv. glycinea.

7. Рівень стійкості сорту люпину до збудника бурої бактеріальної плямистості залежить від вмісту у ньому алкалоїдів, а саме: безалкалоїдні чутливі, мало та високоалкалоїдні відносно резистентні.

8. Показано здатність збудників бурої бактеріальної плямистості люпину уражати широке коло бобових культур, що необхідно враховувати при створенні коректної сівозміни.

Публікації автора:

1. Гвоздяк Р.І., Данкевич Л.А., Воцелко С.К., Голубец О.В. Жирнокислотний склад клітинних ліпідів колекційних та свіжовиділених штамів „Pseudomonas lupinі” // Микробиол. журн. 2005. – Т.67., № 5. С.2836. (Здобувачем самостійно підібрано оптимальний для фітопатогенних псевдомонад метод екстракції жирних кислот та вивчено жирнокислотний склад клітинних ліпідів 23 штамів „P. lupinі”)

2. Данкевич Л.А., Гвоздяк Р.І. Антигенний склад штамів „Pseudomonas lupinі”, виділених у 1963 та 2002 роках. // Микробиол. журн. – 2005. – Т.67., № 6. – С.24–32. (Здобувачем самостійно досліджено антигенні властивості 18 штамів „P. lupinі” та проведено їх серогрупування)

3. Данкевич Л.А., Гвоздяк Р.І. Генотипові властивості збудника бурої бактеріальної плямистості люпину // Біополімери і клітина. – 2006. – Т.22., № 2. – С.121–126. (Здобувачем самостійно визначено вміст ГЦ складу геномної ДНК та проаналізована нуклеотидна послідовність гену 16S рРНК 7 штамів „P. lupinі” та типового штаму P. syringae pv. syringae В1027)

4. Данкевич Л.А. Спеціалізація „Pseudomonas lupini” на люпині, горосі, квасолі та сої // Науковий вісник Чернівецького університету: Збірник наук. праць. – 2004. – Вип. 194. – С. 47 – 52.

5. Данкевич Л.А., Гвоздяк Р.І. Патогенні та біохімічні властивості збудника бурої бактеріальної плямистості люпину „Pseudomonas lupinі” // Агроекологічний журнал. – 2005. – №1 –C.63–68.( Здобувачем самостійно досліджені патогенні, морфологічні, культуральні, фізіологічні та біохімічні властивості 23 штамів „P. lupinі”)

6. Данкевич Л.А., Мороз C.М., Кищенко В.А., Голубец О.В. Жирнокислотний склад клітинних ліпідів „Pseudomonas lupinі” // Вісник Одеського Національного Університету. Серія: Біологія. –2005. Т.10– Вип. 3. – С. 147 – 180. (Здобувачем самостійно вивчено жирнокислотний склад клітинних ліпідів колекційних штамів „P. lupinі”)

7. Данкевич Л.А. Патогенные и биохимические свойства „Pseudomonas lupini ”// 8–я Пущинская школа–конф. молодых ученых «Биология наука XXI века»: Сборник тезисов (17 – 21 мая, 2004 г.). – Пущино: Пущинский научный центр РАН, Ин-т физико-химических и биологических проблем почвовединия РАН, 2004. – С.147.

8. Данкевич Л.А., Яковлева Л.М. Антигенная гетерогенность „Pseudomonas lupinі” // Современное состояние и перспективы развития микробиологии и биотехнологии: Материалы Международной конференции (26–28 мая 2004 г.). Минск: Национальная академия наук Беларуси, Ин-т микробиологии, 2004. – С.16 – 17.

9. Данкевич Л.А., Мороз С.М. Жирнокислотний склад клітинних ліпідів „Pseudomonas lupinі” // X з'їзд Товариства мікробіологів України: Тези доповідей (15-17 вересня). Одеса, 2004. – С.43.

10. Данкевич Л.А. Хактеристика клеточных липидов „Pseudomonas lupini” по жирнокислотному составу // 9–ая Пущинская школа–конференция молодых ученых «Биология наука XXI века»: Сборник тезисов (18 – 22 апреля, 2005 г.). – Пущино: Пущинский научный центр РАН, Ин-т физико-химических и биологических проблем почвовединия РАН, 2005. – С.189.

11. Данкевич Л.А. Залежність жирнокислотного складу загальних клітинних ліпідів Pseudomonas syringae від методу їх виділення // Молодь і поступ у біології: Матеріали Першої Міжнародної конференції студентів і аспірантів (11 – 14 квітня 2005 р.). – Львів: Львівський нац. ун-т ім. Івана Франка, 2005. –С.163.

12. Данкевич Л.А., Гвоздяк Р.І. Генотипові властивості збудника бурої бактеріальної плямистості люпину „Pseudomonas lupini” // 4та Міжнародна конференція «Фітопатогенні бактерії. Фітонцидологія. Алелопатія.»: Тези доповідей (45 жовтня 2005 р.).– Київ, Ін-т мікробіології і вірусології
ім. Д.К. Заболотного НАНУ, 2005. – С.50