Анотація до роботи:

Михальченко В.Г. Молекулярні механізмі регуляції експресії 6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази в різних органах експериментальних тварин. – Рукопис.

Дисертація на здобуття наукового степеня кандидата біологічних наук за спеціальністю 03.00.04 – біохімія. Київський національний університет імені Тараса Шевченка, Київ, 2008.

Дисертація присвячена вивченню молекулярних механізмів регуляції гліколізу на рівні експресії PFKFB в різних органах тварин при гіпоксії та цукровому діабеті. Встановлено, що експресія PFKFB-3 та її сплайс-варіантів в умовах гіпоксії посилюється, але по-різному в різних органах. При діабеті в різних органах виявлені зміни в експресії мРНК PFKFB-3 та деяких сплайс-варіантів. Виявлені нові сплайс-варіанти PFKFB-3, -4 та -1 у мишей та щурів і визначена їх нуклеотидна послідовність. Варіант мРНК PFKFB-1 сітківки щура відрізнявся від PFKFB-1 печінки змінами в послідовності нуклеотидів і відсутністю залишку серину, відповідального за негативну регуляцію активності, а сплайс-варіант мРНК PFKFB-4 мав делецією в бісфосфатазному домені і його експресія виявлялась лише в головному мозку при діабеті.

1. Визначені зміни в експресії мРНК 6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази-1, -3 та -4 та їх альтернативних сплайс-варіантів у різних органах лабораторних тварин при гіпоксії та експериментальному цукровому діабеті, а також виявлені нові унікальні альтернативні сплайс-варіанти різних 6-фосфофрукто-2-кіназ/фруктозо-2,6-бісфосфатаз.

2. Встановлено, що експресія мРНК 6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази-3 та її альтернативних сплайс-варіантів в умовах гіпоксії посилюється, але по-різному в різних органах мишей.

3. Показано, що в різних органах щурів з експериментальним цукровим діабетом спостерігаються різнонаправлені зміни в експресії мРНК

6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази-3 та деяких її

альтернативних сплайс-варіантів.

4. Встановлено, що експресія мРНК 6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази-1 в сітківці ока щурів при гіпоксії посилюється.

5. Виявлені нові альтернативні сплайс-варіанти мРНК 6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази-1 та -3 у щурів та мишей і визначена їх нуклеотидна послідовність. Варіант мРНК 6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази-1 сітківки ока щурів подібний до PFKFB-1 печінки, але відрізняється від нього відсутністю залишку серину, відповідального за негативну регуляцію активності

6-фосфофрукто-2-кінази.

6. Встановлено, що при експериментальному цукровому діабеті експресія мРНК 6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази-4 посилюється в печінці та мозку і пригнічується в нирках щурів.

7. Показано, що в головному мозку діабетичних щурів індукується експресія нового альтернативного сплайс-варіанту мРНК

6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази-4 з делецією в

бісфосфатазному домені.

Публікації автора:

1. Structure and expression of the 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase-1 in the rat retina / V. G. Mykhalchenko, D. O. Minchenko, A. Y. Bobarykina, O. H. Minchenko // Вісник КНУ імені Тараса Шевченка. – 2006. – Вип. 46-47. – С. 21-23.

Особистий внесок здобувача – проведено виділення РНК, дослідження експресії мРНК PFKFB-1, синтез та клонування кДНК, комп’ютерний аналіз послідовності PFKFB-1.

2. Молекулярні механізми регуляції експресії генів 6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази при гіпоксії / В. Г. Михальченко, A. Ю. Бобарикіна, О. О. Ковтун, О. Г. Мінченко // Вісник КНУ імені Тараса Шевченка. Проблеми регуляції фізіологічних функцій. – 2006. – Вип. 11. – С. 18-24.

Особистий внесок здобувача – проведено аналіз літературних даних по темі і написана частина роботи.

3. Expression of mouse 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase-3 mRNA alternative splice variants in hypoxia / V. G. Mykhalchenko, D. O. Minchenko, K. Tsuchihara, M. Moenner, S. V. Komisarenko, A. Bikfalvi, H. Esumi, O. H. Minchenko // Укр. біохім. журн. – 2008. – Т. 80, № 1. – С. 19-25.

Особистий внесок здобувача – проведено виділення РНК, вивчення експресії мРНК PFKFB-3, синтез та клонування кДНК, комп’ютерний аналіз сплайс-ізоформ PFKFB-3.

4. Експресія мРНК 6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази-3 у щурів із стрептозотоциновим діабетом / В. Г. Михальченко, K. Тсучігара, Д. O. Мінченко, Г. Есумі, O. M. Приступюк, O. Г. Мінченко // Біополімери і клітина. – 2008. – Т. 24, № 3. – С. 260-266.

Особистий внесок здобувача – проведено дослідження експресії мРНК PFKFB-3, синтез та клонування кДНК, комп’ютерний аналіз послідовності PFKFB-3.

5. HIF-dependent regulation of PFKFB genes expression: the role in adaptation to hypoxia / O. H. Minchenko, D. O. Minchenko, A. Y. Bobarykina, I. L. Opentanova, O. O. Kovtun, V. G. Mykhalchenko, O. I. Iljina // VIII World Congress International Society for Adaptive Medicine (ISAM), Moscow, Russia, June 21-24, 2006: abstract. – 2006. – P. 56.

Особистий внесок здобувача – проведено дослідження експресії мРНК PFKFB, аналіз результатів і підготовлена доповідь.

6. A dominant/negative isoforms of 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase / D. O. Minchenko, A. Y. Bobarykina, I. L. Opentanova, V. G. Mykhalchenko, O. H. Minchenko // Ukrainian-German Symposium on Nanobiotechnologyk, Kyiv, Ukrainе, December 14-16, 2006: abstract. – 2006. – P. 106.

Особистий внесок здобувача – приймала участь в проведенні досліджень по вивченню експресії мРНК PFKFB і підготовці доповіді.

7. Вплив гіпоксії на експресію мРНК PFKFB в ракових клітинах підшлункової залози та шлунку / А. Ю. Бобарикіна, Д. О. Мінченко, В. Г. Михальченко, О. Г. Мінченко, О. І. Ільїна // 3 міжнародна наукова конференція студентів та аспірантів „Молодь та поступ біології”, Львів, Україна, 23-27 квітня 2007 р.: тези доп. – 2007. – C. 390.

Особистий внесок здобувача – приймала участь в проведенні досліджень по вивченню експресії PFKFB в ракових клітинах і підготовці доповіді.

8. Михальченко В. Г. Молекулярні механізми експресії 6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази в різних органах гризунів / В. Г. Михальченко, О. Г. Мінченко, А. Ю. Бобарикіна // 3 міжнародна наукова конференція студентів та аспірантів „Молодь та поступ біології” Львів, Україна , 23-27 квітня 2007 р.:. – 2007. – C. 78-79.

Особистий внесок здобувача – проведені дослідження по вивченню експресії мРНК PFKFB і підготовлена доповідь.

9. Михальченко В. Г. Експресія мРНК 6-фосфофрукто-2-кінази/фруктозо-2,6-бісфосфатази-3 у щурів із стрептозотоциновим діабетом / В. Г. Михальченко // 4 міжнародна науково-практична конференція студентів, аспірантів та молодих вчених „Шевченківська весна”, Kиїв, Україна, 20-23 березня 2008 р.: тези доп. – 2008. – C. 77-78.

Особистий внесок здобувача – проведені дослідження по вивченню експресії мРНК PFKFB при діабеті, підготовлена доповідь.

10. Mus musculus 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3 splice variant 2 (Pfkfb3) mRNA, complete cds, alternatively spliced / O. H. Minchenko, K. Tsuchihara, D. O. Minchenko, A. Y. Bobarykina, V. G. Mykhalchenko, S. V. Komisarenko, H. Esumi // GenBank accession EU034676. – 13-AUG-2007.

Особистий внесок здобувача – приймала участь в проведені досліджень по виявленню сплайс-варіанту мРНК PFKFB і підготовці статті.

11. Rattus norvegicus 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3 splice variant (Pfkfb3) mRNA, complete cds, alternatively spliced / O. H. Minchenko, K. Tsuchihara, D. O. Minchenko, V. G. Mykhalchenko, A. Y. Bobarykina // GenBank accession EU034674. – 13-AUG-2007.

Особистий внесок здобувача – проведені дослідження по виявленню сплайс-варіанту мРНК PFKFB і підготовлена стаття.

12. Mus musculus 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3 splice variant 1 (Pfkfb3) mRNA, complete cds, alternatively spliced / O. H. Minchenko, K. Tsuchihara, D. O. Minchenko, A. Y. Bobarykina, V. G. Mykhalchenko, H. Esumi // GenBank accession EU034675. – 13-AUG-2007.

Особистий внесок здобувача – приймала участь в проведені досліджень по виявленню сплайс-варіанту мРНК PFKFB і підготовці статті.

13. Rattus norvegicus 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase-4 transcript variant 2 (Pfkfb4) mRNA, complete cds, alternatively spliced / D. O. Minchenko, Y. O. Paustovsky, O. P. Yavorovsky, V. G. Mykhalchenko, O. H. Minchenko, H. Esumi, K. Tsuchihara // GenBank accession EU404101. – 07-FEB-2008.

Особистий внесок здобувача – проведені дослідження по виявленню сплайс-варіанту мРНК PFKFB і підготовлена стаття.

14. Rattus norvegicus 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase-4 transcript variant 3 (Pfkfb4) mRNA, complete cds, alternatively spliced / D. O. Minchenko, Y. O. Paustovsky, O. H. Minchenko, O. P. Yavorovsky, V. G. Mykhalchenko, K. Tsuchihara, H. Esumi // GenBank accession EU404102. – 07-FEB-2008.

Особистий внесок здобувача – приймала участь в проведені досліджень по виявленню сплайс-варіанту мРНК PFKFB і підготовці статті.

15. Mus musculus 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2 transcript variant 2 (Pfkfb2) mRNA, complete cds, alternatively spliced / D. O. Minchenko, O. H. Minchenko, K. Tsuchihara, S. Kanehara, V. G. Mykhalchenko, H. Esumi // GenBank accession EU334169. – 13-JAN-2007.

Особистий внесок здобувача – проведені дослідження по виявленню сплайс-варіанту мРНК PFKFB і підготовлена стаття.

16. Mus musculus 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2 splice variant 3 (Pfkfb2) mRNA, complete cds, alternatively spliced / D. O. Minchenko, K. Tsuchihara, O. H. Minchenko, M. Moenner, S. Kanehara, V. G. Mykhalchenko, H. Esumi // GenBank accession number EU616666. – 15-MAY-2008.

Особистий внесок здобувача – приймала участь в проведені досліджень по виявленню сплайс-варіанту мРНК PFKFB і підготовці статті.

17. Mus musculus 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 2 splice variant 4 (Pfkfb2) mRNA, complete cds, alternatively spliced / D. O. Minchenko, O. H. Minchenko, K. Tsuchihara, H. Esumi, J. Caro, V. G. Mykhalchenko, M. Moenner, A. Bikfalvi, S. V. Komisarenko // GenBank accession number EU616667. – 05-MAY-2008.

Особистий внесок здобувача – проведені дослідження по виявленню сплайс-варіанту мРНК PFKFB і підготовлена стаття.