Анотація до роботи:

Дмитренко І.В. Молекулярно-генетичні порушення, асоційовані з гострими лейкеміями у дітей

Дисертація (рукопис) на здобуття наукового ступеня кандидата біологічних наук за спеціальністю 03.00.15 – генетика. Науковий центр радіаційної медицини АМН України, Київ, 2006.

В дисертації наведено результати дослідження порушень каріотипу, експресії химерних генів, клональних перебудов генів Ig, порушень в мікросателітній ДНК в співставлені з показниками перебігу гострих лейкемій у дітей. Показано, що наявність клітин із спорідненими клонами є прогностично несприятливою ознакою перебігу гострих лейкемій, а ПЛР-позитивні хворі щодо генів AML1/ETO та TEL/AML1 мають кращу відповідь на терапію. Виявлено, що клональні перебудови генів імуноглобулінів, а також порушення в мікросателітних локусах D9S171 та D12S98 можуть бути використані як молекулярний маркер пухлинного клону у дітей, хворих на гострі лімфобластні лейкемії. Встановлено, що оцінка мінімальної резидуальної хвороби, яка заснована на скринінгу химерних транскриптів та клональних порушень генів імуноглобулінів, дозволяє виділити пацієнтів з вищим ризиком розвитку раннього рецидиву гострих лейкемій. На підставі отриманих даних було розширено спектр генетичних критеріїв прогнозування перебігу захворювання. Розроблено оптимальну схему досліджень генетичних порушень у дітей з гострими лейкеміями.

У дисертаційній роботі наведене наукове узагальнення та нове вирішення актуальної задачі – розширення спектру генетичних критеріїв прогнозування перебігу захворювання та розробки оптимальної схеми досліджень генетичних порушень у дітей з гострими лейкеміями на основі дослідження генетичних маркерів клональної природи лейкемічного процесу: хромосомних порушень, химерних генів, перебудов генів імуноглобулінів та порушень мікросателітної ДНК.

1. Клональні порушення на генному, хромосомному та геномному рівнях визначаються як генетичні маркери пухлинних клонів. Їх аналіз надає можливість не тільки судити про ступінь злоякісності пухлини, але і проводити ранню ідентифікацію маркерів несприятливого прогнозу щодо перебігу хвороби, а також моніторинг МРХ та ерадикації пухлинного клону. Найбільш важливим прогностичним чинником є не наявність чи відсутність, а саме характер генетичних аномалій, а також їх динаміка в процесі лікування.

2. Складні клональні зміни каріотипу під час первинного встановлення діагнозу є незалежним прогностично несприятливим чинником індивідуальної відповіді на терапію, не зважаючи на присутність специфічних прогностично сприятливих цитогенетичних порушень. Наявність клітин із спорідненими клонами свідчить про прогресію захворювання. Їх теж можна розглядати як прогностично несприятливу ознаку.

3. Характер і частота порушень каріотипу у дітей залежить від варіанта лейкемії. Делеція 16-ї хромосоми в сегменті 16q13 специфічна для хворих на ГМЛ і не погіршує прогноз перебігу захворювання.

4. Експресія химерних генів вірогідно частіше зустрічається у дітей з ГМЛ, ніж дітей з ГЛЛ. Для ГМЛ специфічними визначені транскрипти MLL/AF9, AML1/ETO, CBFB/MYH11, а для ГЛЛ – BCR/ABL p190, TEL/AML1 і E2A/PBX1. У групі хворих на ГМЛ транскрипт CBFB/MYH11 специфічний для М4Ео-варіанту, а AML1/EТО виявляється не тільки при М2-варіанті. Це обумовлює необхідність його дослідження у всіх хворих на ГМЛ. Чинником сприятливого перебігу захворюваня є не наявність, а тип химерного гена. ПЛР-позитивні хворі щодо генів AML1/ETO та TEL/AML1 мають кращу відповідь на терапію.

5. Клональні перебудови генів імуноглобулінів є специфічними для лімфоїдної злоякісної проліферації і можуть бути використані як молекулярний маркер пухлинного клону у хворих на ГЛЛ. Залучення декількох пар праймерів для кожного гена, а також аналіз двох генів імуноглобулінів (IgH та IgK) підвищує ефективність виявлення клональності.

6. Оцінка мінімальної резидуальної хвороби, яка заснована на скринінгу химерних транскриптів та клональних порушень генів імуноглобулінів, дозволяє виділити пацієнтів з вищим ризиком розвитку раннього рецидиву після звичайних хіміотерапевтичних курсів та ТСККПК. При дослідженні МРХ сприятливим прогностичним чинником є відсутність маркерів пухлинних клонів на стадії ремісії. Щодо клональних перебудов генів імуноглобулінів, краща відповідь на терапію спостерігається у хворих, у яких зареєстровано зникнення обох маркерів клональності.

7. У хворих на ГЛЛ в мікросателітних локусах D9S171 та D12S98 частіше має місце втрата гетерозиготності, ніж поява нового алеля. Порушення в мікросателітній ДНК можуть бути використані як молекулярний маркер пухлинного клону в цій групі хворих.

8. Вибір оптимального спектру пухлинних маркерів і удосконалення схеми молекулярно-генетичного обстеження дітей, хворих на гострі лейкемії, обгрунтовується специфічністю порушень каріотипу, химерних генів і клональних перебудов генів імуноглобулінів, а також специфічністю мікросателітних змін для конкретних варіантів гострих лейкемій.

Публікації автора:

1. Клінічне значення молекулярних маркерів пухлинних клонів у пацієнтів з гострими лейкеміями при проведенні трансплантації кісткового мозку / В.Г. Бебешко, Ж.М. Мінченко, І.В. Дмитренко, О.В. Кучер, Н.М. Цвєткова, І.А. Крячок. Ж.А. Мішаріна, С.В. Клименко, В.І. Хоменко // Трансплантологія. – 2004. – Т. 6, № 2. – С. 61–65.

Особистий внесок – дослідження експресії химерних генів та мутацій гену FLT-3 у хворих на гострі лейкемії. Участь в аналізі матеріалу та написанні.

2. AML1 gene rearrangements and mutations in radiation-associated acute myeloid leukemia and myelodysplastic syndrome / S.V. Klymenko, K. Trott, M.J. Atkinson, K. Bink, V.G. Bebeshko, D.A. Bazyka, I.V. Dmytrenko, I.V. Abramenko, N. Bilous, H. Zitzelsberger, M. Rosemann // Journal of Rad. Research. –2005. – Vol. 46. – P. 249–255.

Особистий внесок – дослідження експресії гену AML1/ETO методом ЗТ-ПЛР у хворих на ГЛ та МДС. Участь в аналізі матеріалу та написанні.

3. MLL gene alterations in radiation-associated acute myeloid leukemia / S.V. Klymenko, K. Bink, K.R. Trott, V.G. Bebeshko, D.A. Bazyka., I.V. Dmytrenko, I.V. Abramenko, N.I. Bilous, H. Zitzelsberger, A.V. Misurin, M.J. Atkinson, M. Roserman // Experimental oncology. – 2005. – Vol. 27, N 1. – P. 71–75.

Особистий внесок – дослідження експресії химерних генів, що задіюють MLL, у хворих на ГМЛ. Участь в аналізі матеріалу та написанні.

4. Досвід використання молекулярно-генетичних методів дослідження в діагностиці лейкемій у дітей / В.Г. Бебешко, Ж.М. Мінченко, К.М. Бруслова, І.В. Дмитренко, О.В. Кучер, О.Є. Кузнєцова, В.Д. Дроздова, Н.О. Кубаля // Український журнал гематології та трансфузіології. – 2005. – № 6. – С. 15–20.

Особистий внесок – дослідження експресії химерних генів у дітей, хворих на гострі лейкемії. Аналіз матеріалу та написання.

5. Мінченко Ж.М., Дмитренко І.В., Кучер О.В. Реаранжировки генів імуноглобулінів і перебудови мікросателітної ДНК як маркери пухлинної клональності при гострій лімфобластній лейкемії у дітей // Проблеми екологічної та медичної генетики і клінічної імунології. – 2005. – № 5. – С. 16–27.

Особистий внесок – дослідження клональних перебудов генів імуноглобулінів методом ПЛР, вивчення мікросателітної нестабільності методом ПЛР з подальшим сіквенуванням, статистичний аналіз матеріалу. Написання та оформлення роботи.

6. Genetic markers of the acute leukemia in children / V.G. Bebeshko, J.N. Minchenko, O.V. Kucher, K.M. Bruslova, J.A. Misharina, O.O. Dmytrenko, I.V. Dmytrenko // Materials of III scientific-practice conference “Ontogenetic problems: scientific and applied aspects”, Kiev, Ukraine, 2002. Оncology. – 2002. – Vol. 4, Suppl. – P. 6–7.

Особистий внесок – цитогенетичні та молекулярно-генетичні дослідження. Аналіз матеріалу та написання роботи.

7. Molecular research of fusion genes in children acute leukemias / I.V. Dmytrenko, J.N. Minchenko, O.V. Kucher, V.G. Fedorenko, K.M. Bruslova, V.G. Bebeshko, V.D. Drozdova, V.I. Khomenko // 8-th Annual Congress of the European Hematologic Association, Lyon, 2003. The Hematology Journal. – 2003. – Vol. 4, Suppl. 2. – P. 311.

Особистий внесок – дослідження експресії химерних генів методом ЗТ-ПЛР у дітей, хворих на ГЛ. Участь в аналізі і синтезі матеріалу та написанні.

8. The prediction of acute leukemias current at children / E.V. Kucher, V.G. Bebeshko, J.N. Minchenko, K.M.Bruslova, I.V.Dmytrenko, E.A. Dmytrenko // 8-th Annual Congress of the European Hematologic Association, Lyon, 2003. The Hematology Journal. – 2003. – Vol. 4, Suppl. 2. – P. 287.

Особистий внесок – дослідження каріотипу та експресії химерних генів. Участь в аналізі та написанні.

9. AML1 gene rearrangements in radiation-associated acute myeloid leukemia and myelodysplastic syndrome / S.V. Klymenko, M.J. Atkinson, V.G. Bebeshko, D.A. Bazyka, K. Bink, I.V. Dmytrenko, I.V. Abramenko, N. Bilous, H. Zitzelsberger, M. Rosemann // 9-th Annual Congress of the European Hematologic Assosiation, Zeneva, 2004. The Hematology Journal. – 2004. – Vol. 5. – Suppl. 2. – P. S76–S77.

Особистий внесок – дослідження експресії химерного гену AML1/ETO у хворих на ГЛ та МДС. Участь в аналізі матеріалу та написанні.

10. Genetic risk factors of acute leukaemias in children suffered from Chernobyl Accident / I.V. Dmytrenko, J.M. Minchenko, O.A. Dmytrenko, T.Y. Shlyachtychenko, O.V. Kucher, N.M. Tsvyetkova, K.M. Bruslova, V.G. Bebeshko // 9-th Annual Congress of the European Hematologic Assosiation, Zeneva, 2004. The Hematology Journal. – 2004. – Vol. 5. – Suppl. 2. – P. 278.

Особистий внесок – дослідження каріотипу та молекулярно-генетичні дослідження у дітей, хворих на лейкемії, які постраждали від Чорнобильської аварії. Участь в аналізі матеріалу та написанні.

11. Прогностическое значение клональных перестроек генов легких и тяжелых цепей иммуноглобулинов у детей с острыми лимфобластными лейкемиями / И.В. Дмитренко, Ж.Н. Минченко, Е.М. Бруслова, В.Г. Бебешко // Матеріали науково-практичної конференції “Гематологія і трансфузіологія: фундаментальні та прикладні питання”, Київ, 2005. Український журнал гематології та трансфузіології. – 2005. – № 4. – С. 42.

Особистий внесок – дослідження химерних генів та клональних перебудов генів Ig, статистичний аналіз матеріалу. Написання та оформлення.

12. Association of the molecular-genetic disturbances and markers of various genetic blood systems in patients with oncohematologic pathology with features of diseases flowing on different steps of the hemopoetic cells transplantation/ I.V. Dmytrenko, V.G. Bebeshko, J.M. Minchenko, O.O. Dmytrenko, N.M. Tsvetkova, O.V. Kucher, I.A. Kryachok, S.V. Klymenko, T.Y. Shlyahtichenko // 5-th Parnas Conference “Molecular mechanisms of cellular signaling”, Kyiv, 2005. The Ukrainian biochemical journal. – 2005. – Vol. 77, N 2. – P. 168.

Особистий внесок – дослідження експресії химерних генів та мутацій гену FLT-3. Участь в аналізі матеріалу та написанні.