Анотація до роботи:

Гусар В.А. Оцінка різноманіття гаплотипів мітохондріальної ДНК населення України. – Рукопис.

Дисертація на здобуття наукового ступеня кандидата медичних наук за спеціальністю 03.00.15 – генетика. – Український інститут клінічної генетики Харківського державного медичного університету, Харків, 2007.

У популяційній вибірці й вибірці пацієнтів із клінічно встановленою мітохондріальною патологією визначено гіперваріабельні позиції ГВС I та розраховано показники генетичного різноманіття мтДНК, які свідчать про високу генетичну гетерогенність. Розраховано частоти гаплогруп і визначені філогенетичні відносини гаплотипів мтДНК, що вказують на наявність спільних типів мтДНК із фіно-угорськими та германськими популяціями. У вибірці пацієнтів визначені додаткові поліморфізми (генетичний фон) у гаплогрупах U5, Т та Х, які в поєднанні з їх основними мотивами, можуть відігравати певну роль у прояві мітохондріальних захворювань.

У дисертаційній роботі проведена оцінка генетичної різноманітності й ступеню споріднення мітохондріальних гаплотипів населення України. Визначено поліморфізм індивідуальних геномів мтДНК пробандів із клінічно встановленою мітохондріальною патологією для оцінки впливу генетичного фону на прояв мітохондріальних захворювань у обстеженій популяції.

1. Визначено 102 поліморфних позиції ГВС I мтДНК у популяційній вибірці, серед яких виявилися найбільш варіабельними: 16093, 16189, 16311, 16362. У вибірці пацієнтів із клінічно встановленою мітохондріальною патологією визначено 55 поліморфних позиції з найбільш варіабельними – 16189 і 16294.

2. Розраховані показники генетичної різноманітності (D і ) в обстежених вибірках, що склали 0.992±0.0019 і 5.19; 0.990±0.007 і 6.13, відповідно. Рівні показників свідчать про високу генетичну гетерогенність та присутність фіно-угорського й германського субстратів у сучасній популяції українців, що ймовірно обумовлена істотною роллю процесів метисації та асиміляції. Визначена подібність із генофондами західних та південних слов’ян, а серед східних слов’ян - з росіянами обумовлена спільністю їх походження.

3. Визначений поліморфізм у генах тРНК^lys і тРНК^leu кодуючого регіону мтДНК у вибірці пацієнтів із клінічно встановленою мітохондріальною патологією. Виявлена 21 гомоплазмічна позиція (13 синонімічних і 8 несинонімічних). Знайдені мутації в пацієнтів з типами ГВС I мтДНК, які визначають гаплогрупи Н (14553С/Т Valile ND6) і Х (12706C Pheleu ND5). Результати, які отримали, дозволяють припустити вплив популяційного генетичного фону на інтенсивність мутаційних процесів і фенотипову експресію захворювання.

4. Розраховані частоти гаплотипів у популяційній вибірці, які вказують на наявність виразного європеоїдного компоненту, що був представлений відповідними гаплогрупами (H, pre-V, V, HV, J, T, U, K, I, W, X, N). Їх сумарна частота склала 95.6%. Найбільшу поширеність мають гаплогрупи H, U, J, T (72.8%). Також виявлені азійські гаплогрупи A, B, C, D і Z із частотою 2.0%.

5. Розрахунок частот гаплотипів у вибірці пацієнтів із клінічно встановленою мітохондріальною патологією продемонстрував наявність євроспецифічних гаплогруп: H, pre-V, V, J, T, U, I, W та X, сумарна частота яких склала 86.0%. Азійські гаплогрупи (А і C) виявлені із частотою 4.0%. Показана висока частота гаплогруп U5 (14.0%), Т (16.0%) і Х (8.0%) в досліджуваній вибірці, у порівнянні із контрольною, яка, найімовірніше, обумовлена гіперваріабельністю позицій 16189 і 16294, що утримуються в основних нуклеотидних мотивах даних гаплогруп.

6. Детальний філогенетичний аналіз гаплотипів у популяції українців продемонстрував подібність із генофондами європейських популяцій. Наявність спільних типів мтДНК із фіно-угорськими та германськими популяціями обумовлена істотною роллю процесів асиміляції і метисації в етногенезі українців.

7. Філогенетичний аналіз гаплотипів у вибірці пацієнтів виявив додаткові популяційні поліморфізми (генетичний фон) у гаплогрупах U5, Т та Х, які в поєднанні з їх основними мотивами, можуть відігравати певну роль у прояві мітохондріальних захворювань.

Публікації автора:

1. Гусар В.А. Мінливість та поліморфізм мітохондріальної ДНК української популяції // Журнал АМН України. – 2006. – Т.12, №4. – С.739-749.

2. Жаданов С.И., Гречанина Е.Я., Гречанина Ю.Б., Гусар В.А., Федосеева Н.П., Шурр Т. Изучение митохондриальных заболеваний в Украине: случай мутации ND5 de novo, значение патогенетических механизмов генных дефектов мтДНК ND5 // Журнал АМН України. – 2006. –Т.12, №3. – С.443-456.

3. Гусар В.А., Григоров С.Н. Характеристика гаплотипов митохондриальной ДНК украинской популяции //Ультразвуковая перинатальная диагностика. – 2002. – №15. – С. 39-44.

4. Гречаніна Ю.Б., Гусар В.А., Мінков А.І., Григоров С.М. Мітохондріальні хвороби: проблеми діагностики, лікування та профілактики // Ультразвуковая перинатальная диагностика. – 2002. – №15. – С. 44-71.

5. Zhadanov S.I., Grechanina E.Ya., Grechanina Yu.B., Gusar V.A., Fedoseeva N.P., Lebon S., Mnnich A., Schurr T.G. Fatal manifestation of a de novo ND5 mutation: Insights into the pathogenic mechanisms of mtDNA ND5 gene defects // Mitochondrion. 2007. – №7. – P.260-266.

6. Loogvali E.L., Roostalu U., Malyarchuk B.A., Derenko M.V., Kivisild T., Metspalu E., Tambets K., Reidla M., Tolk H.-V., Parik J., Pennarun E., Laos S., Lunkina A., Golubenko M., Barac L., Pericic M., Balanovsky O.P., Gusar V., Khusnutdinova E.K., Stepanov V., Puzyrev V., Rudan P., Balanovska E.V., Grechanina E., Richard C., Moisan J.P., Chaventre A., Anagnou N.P., Pappa K.I., Michalodimitrakis E.N., Claustres M., Golge M., Mikerezi I., Usanga E., Villems R. Disuniting uniformity: a pied cladistic canvas of mtDNA haplogroup H in Eurasia // Mol. Biol. Evol. 2004. – V.21. – №11. – P.2012-2021.

7. Tambets K., Rootsi S., Kivisild T., Help H., Serk P., Loogvli E.-L., Tolk H.-V., Reidla M., Metspalu E., Pliss L., Balanovsky O., Pshenichnov A., Balanovskaya E., Gubina M., Zhadanov S., Osipova L., Damba L., Voevoda M., Kutuev I., Bermisheva M., Khusnutdinova E., Gusar V., Grechanina E., Parik J., Pennarun E., Richard C., Chaventre A., Moisan J.-P., Barac L., Pericic M., Rudan P., Terzic R., Mikerezi I., Krumina A., Baumanis V., Koziel S., Rickards O., Stefano G. F., Anagnou N., Pappa K.I., Michalodimitrakis E., Ferk V., Fredi S., Komel R., Beckman L., Villems R. The western and eastern roots of the Saami - the story of genetic "outliers" told by mitochondrial DNA and Y-chromosome // Am. J. Hum. Genet. 2004. – V.74. – P.661-682.

8. Kharkov V.N., Stepanov V.A., Borinskaya S.A., Kozhekbaeva Zh.M., Gusar V.A., Grechanina E.Ya., Puzyrev V.P., Khusnutdinova E.K., Yankovsky N.K. Gene pool structure of eastern Ukrainians as inferred from the Y-chromosome haplogroups // Human genetics. 2004. – V.40. – № 3. – P.415-421.

9. Харьков В.Н., Степанов В.А, Боринская С.А., Кожекбаева Ж.М., Гусар В.А., Гречанина Е.Я., Пузырев В.П., Хуснутдинова Э.К., Янковский Н.К. Структура генофонда восточных украинцев по гаплогруппам Y-хромосомы // Генетика человека. – 2004. – Т.40. – №3. – С.1-6.

10. Reidla M., Kivisild T., Metspalu E., Kaldma K.,Tambets K., Tolk H.-V., Parik J., Loogvali E.-L., Derenko M., Malyarchuk B., Bermisheva M., Zhadanov S., Pennarun E., Gubina M., Golubenko M., Damba L., Fedorova S., Gusar V., Grechanina E., Mikerezi I., Moisan J.-P., Chaventre A., Кhusnutdinova E., Osipova L., Stepanov V., Voevoda M., Achilli A., Rengo C., Rickards O., Stefano G. F., Papiha S., Beckman L., Janicijevic B., Rudan P., Anagnou N., Michalodimitrakis E., Koziel S., Usanga E., Geberhiwot T., Herrnstadt C., Howell N., Torroni A., Villems R. Origin and diffusion of mtDNA Haplogroup X // Am. J. Hum. Genet. 2003. –V.73. – P.1178-1190.

11. Пат. № 23577 Україна. Спосіб діагностики мітохондропатій / Гречаніна О.Я., Гречаніна Ю.Б., Гусар В.А., Здибська О.П., Васильєва О.В. (Україна) Опубл. 25.05.2007, Бюл. № 7.

12. Yankovsky N., Tambets K., Orekhov V., Rootsi S., Injutin A., Adojaan M., Kozhekbaeva J., Bermisheva M., Gusar V., Grechanina E., Kivisild T., ParikY., Ivanov P., Khusnutdinova E., Villems R. MtDNA and Y chromosome diversity of eleven ethnic group from Eastern Europe // Human Genome meeting. Edinburgh, 2001. – P.1392.

13. Orekhov V., Tambets K., Rootsi S., Injutin A., Adojaan M., Kozhekbaeva J., Bermisheva M., Viktorova T., Gusar V., Grechanina E., Kivisild T., Parik Y., Ivanov P., Yankovsky N., Khusnutdinova E., Villems R. MtDNA lineage from European part of Russia: a clue to reveal prehistoric demographic and migration processes // BDENE: WITA. Novosibirsk, Russia, 2001. – P.316.

14. Гречанина Е.Я., Гусар В.А., Гречанина Ю.Б., Пронькина Н.В. Изучение гаплотипов для установления корреляции с митохондриальными заболеваниями // I Международная студенческая конференция по медицинской генетике: Тезисы докладов. – Харьков. – 2001. – С.30-33.

15. Grechanina O.Y., Novikova I.V., Moskalets N.V., Grechanina Y.B., Gusar V.A. Detection of inherited metabolic disorders in the region of Kharkov/Ukraine // Laboratorine Medicina: 8th AAEWIEM. – 2002. – P. 60.

16. Виллемс Р., Гусар В.А. Полиморфизм митохондриальной ДНК // Медицина третього тисячоліття: Тези доповідей Конференції молодих вчених ХДМУ, 17-18 січня 2002. – Харків. – 2002. – С.179.

17. Гречаніна Ю.Б., Гусар В.А., Гречанін Б.Є., Новікова І.В. Мітохондропатії в патології людини // III з’їзд медичних генетиків в Україні: Тези доповідей, 2-4-жовтня 2002. – Львів. – 2002. – С. 28.

18. Гусар В.А., Виллемс Р., Гречанина Е.Я. Определение взаимоотношений украинцев и «генетической Евы» // III з’їзд медичних генетиків в Україні: Тези доповідей, 2-4-жовтня 2002. – Львів. – 2002. – С. 32.

19. Гречанина Ю.Б., Гусар В.А. Современные аспекты митохондропатий // Биология – наука 21 века: Тезисы 7 Пущинской школы-конференции молодых ученых. – Пущино. – 2003. – С.17.

20. Гусар В.А., Гречанина Ю.Б., Гречанина Е.Я. Характеристика гаплотипов мтДНК украинской популяции // Биология – наука 21 века: Тезисы 7 Пущинской школы-конференции молодых ученых. – Пущино. – 2003. – С.325.

21. Кожекбаева Ж.М., Боринская С.А., Тяжелова Т., Спицин В.А., Гусар В.А., Гречанина Е.Я., Фещенко С.П., Янковский Н.К. Полиморфизм некоторых генов, связанных с общераспространенными заболеваниями, в трех восточно-славянских популяциях // Проблеми клінічної генетики: Тези I Українського Конгресу з клінічної генетики з міжнародною участю. – Харків, 2003. – С.209-210.

22. Гусар В.А. Структура митохондриального генофонда украинской популяции // Медицина третього тисячоліття: Тези Міжвузівської конференції молодих вчених ХДМУ. – Харків. – 2007. – С.89.

23. Zhadanov S., Grechanina E., Grechanina Yu., Gusar V., Fedoseeva N., Lebon S., Mnnich A., Schurr T. MtDNA mutations in Leigh syndrome expression: recurrent incidence of the ND5 genetic defect // 56^th Annual Meeting Am. Soc. Hum. Genet. USA, 2006. – P. 269.

24. Гречанина Е.Я., Здыбская Е.П., Гусар В.А. Митохондриальная болезнь в сочетании с опухолью надпочечника: описание случая // Ультразвуковая перинатальная диагностика. – 2006. – №21. – С. 39-41.

25. Grechanina E.Ya., Gusar V.A. The structure of mitochondrial genofound of Ukrainian population // 5th European Congress in Newborn Screening. – Reykjavik, 2007. – P. 19.

26. Гречанина Е.Я., Гусар В.А. Спектр и частота гаплотипов митохондриальной ДНК у пациентов с митохондриальными заболеваниями // Актуальні питання медичної генетики: Матеріали науково-практичної конференції з міжнародною участю. – Київ. – 2007. – С.36-38.

27. Grechanina E.Y., Gusar V.A., Villems R. The mitochondrial DNA polymorphism in Ukrainian population // 5th Conference in forensic genetics and molecular anthropology. Croatia, 2007. – P.135.